1. 教程目标
本教程以 Bi₂Se₃ 为例,介绍如何依次使用 VASP、Wannier90 和 WannierTools,得到材料的拓扑边界态(LDOS)和 Berry curvature 分布。
开始计算时,唯一需要自行准备的结构输入文件是正确的 POSCAR。计算过程中还需要以下脚本:
| 脚本 | 用途 |
|---|---|
AutoVASP.sh |
提交 VASP 计算 |
Wannier_cal-new.sh |
提交 VASP + Wannier90 初次拟合计算 |
Disentanglement.sh |
重新调整参数并进行能带拟合 |
tool_25.sh |
提交 WannierTools 计算 |
以上脚本均为当前计算环境中的 LSF 任务脚本,需要通过 bsub 提交到任务队列。以下命令以常见的 LSF 提交方式为例:
bsub < 脚本名.sh
如果所在计算平台规定了其他提交方式,应以平台说明为准。文中的脚本路径和具体输入参数也需要按实际计算环境修改。
2. VASP 计算
2.1 准备输入文件和脚本
首先写好并检查 POSCAR,然后在计算目录中复制一份 AutoVASP.sh:
cp /path/to/AutoVASP.sh .
根据 POSCAR 和具体计算要求修改 AutoVASP.sh。
待补充:
AutoVASP.sh中需要修改的具体参数,例如赝势、截断能、K 点、并行参数、SOC 设置及计算路径等。对于 Bi₂Se₃ 拓扑性质的计算,需要确认流程中正确考虑了 SOC。
2.2 提交计算
修改完成后,使用 bsub 提交任务:
bsub < AutoVASP.sh
2.3 检查计算结果
任务结束后,检查 OUTCAR、scf/、nonscf/ 等文件和文件夹,确认 VASP 计算是否正常完成并达到收敛要求。
如果计算成功,nonscf/ 中应得到:
Proband/- 能带图
Band.jpg
这两个结果是后续检查 Wannier90 拟合质量时主要使用的参考。至此,VASP 计算完成。
3. Wannier90 能带拟合
这一步的目标是使用 Wannier90 拟合 VASP 能带,并得到 wannier90_hr.dat。
3.1 初次拟合
在 AutoVASP.sh 所在的计算目录中复制 Wannier_cal-new.sh:
cp /path/to/Wannier_cal-new.sh .
根据材料和拟合要求修改脚本中的参数,主要包括:
- disentanglement 的内、外能量窗口;
- 用于拟合的投影轨道;
- 与能带数、Wannier 函数数目及计算路径有关的参数。
待补充:两个能量窗口、投影轨道及其他参数的具体设置方法。
修改完成后提交任务:
bsub < Wannier_cal-new.sh
该脚本会依次进行所需的 VASP 和 Wannier90 计算。计算成功后,应在输出文件中找到 wannier90_hr.dat。
3.2 检查拟合质量
需要对照 VASP 得到的能带图,检查 Wannier90 拟合能带是否在关注的能量范围内与 VASP 能带良好重合。同时检查 Wannier 函数的展宽;按现有流程,可在 WT.out 中查看相关结果,并确认展宽与 POSCAR 中的晶格尺度处于合理、可比较的量级。
说明:标准 Wannier90 通常将展宽写入
wannier90.wout。如果当前脚本将相关信息汇总到WT.out,则以脚本的实际输出为准。展宽是否合理还应结合轨道类型、晶格结构和拟合质量判断,不能只依据单一数值。
3.3 重新进行 disentanglement
Wannier90 拟合通常难以一次得到理想结果。如果初次拟合不理想,可新建 fit/ 目录,在其中重新调整参数并进行拟合:
mkdir fit
cd fit
复制所需文件和 Disentanglement.sh 后,重点修改 wannier90.win 中的投影轨道、内外能量窗口等参数,再提交任务:
bsub < Disentanglement.sh
根据拟合结果反复调整,直到 Wannier90 能带在关注的能量范围内能够较好地复现 VASP 能带。
无论初次拟合成功,还是经过 fit/ 中的重新拟合,最终都应得到质量较好的 wannier90_hr.dat。该文件可以看作针对 VASP 能带构建的紧束缚模型,后续可在此基础上计算拓扑边界态和 Berry curvature。
4. WannierTools 计算
下一步使用 WannierTools 计算 LDOS 和 Berry curvature。此阶段需要的主要输入文件为:
wannier90_hr.datwt.in
wt.in 的参数设置可参考现有内部教程中的 WannierTools 一节。LDOS 和 Berry curvature 对应的计算任务不同,因此需要分别修改 wt.in 中的相关参数,不能直接使用同一套设置。
待补充:LDOS 和 Berry curvature 计算所需的
wt.in参数,以及表面方向、费米能级、K 点路径或网格等具体设置。
准备好 wannier90_hr.dat 和 wt.in 后,通过 tool_25.sh 提交计算:
bsub < tool_25.sh
计算完成后,检查 WannierTools 的输出文件,并绘制或查看 LDOS、Berry curvature 对应的结果图。
5. 流程总结
POSCAR
↓
AutoVASP.sh
↓
VASP:SCF + NSCF
↓
Proband/ + Band.jpg
↓
Wannier_cal-new.sh
↓
Wannier90 初次拟合
↓
拟合不理想时:fit/ + Disentanglement.sh
↓
wannier90_hr.dat
↓
wt.in + tool_25.sh
↓
LDOS / Berry curvature 结果图
最终需要重点保存和检查的文件包括:
- VASP 参考能带:
nonscf/Proband/、nonscf/Band.jpg; - Wannier90 紧束缚模型:
wannier90_hr.dat; - WannierTools 输入文件:
wt.in; - WannierTools 输出的 LDOS 和 Berry curvature 数据及图片。